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Amino Acid Table

The table below summarizes RasMol's classification of the natural amino acids in predefined atom sets:

 

  Residues:

ala

arg

asn

asp

cys

glu

gln

gly

his

ile

leu

lys

met

phe

pro

ser

thr

trp

tyr

val

  Atom Set

A

R

N

D

C

E

Q

G

H

I

L

K

M

F

P

S

T

W

Y

V

  acidic

 

 

 

*

 

*

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

  acyclic

*

*

*

*

*

*

*

*

 

*

*

*

*

 

 

*

*

 

 

*

  aliphatic

*

 

 

 

 

 

 

 

 

*

*

 

 

 

 

 

 

 

 

*

  aromatic

 

 

 

 

 

 

 

 

*

 

 

 

 

*

 

 

 

*

*

 

  basic

 

*

 

 

 

 

 

 

*

 

 

*

 

 

 

 

 

 

 

 

  buried

*

 

 

 

*

 

 

 

 

*

*

 

*

*

 

 

 

*

 

*

  charged

 

*

 

*

 

*

 

 

*

 

 

*

 

 

 

 

 

 

 

 

  cyclic

 

 

 

 

 

 

 

 

*

 

 

 

 

*

*

 

 

*

*

 

  hydrophobic

*

 

 

 

 

 

 

*

 

*

*

 

*

*

*

 

 

*

*

*

  large

 

*

 

 

 

*

*

 

*

*

*

*

*

*

 

 

 

*

*

 

  medium

 

 

*

*

*

 

 

 

 

 

 

 

 

 

*

 

*

 

 

*

  negative

 

 

 

*

 

*

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

  neutral

*

 

*

 

*

 

*

*

*

*

*

 

*

*

*

*

*

*

*

*

  polar

 

*

*

*

*

*

*

 

*

 

 

*

 

 

 

*

*

 

 

 

  positive

 

*

 

 

 

 

 

 

*

 

 

*

 

 

 

 

 

 

 

 

  small

*

 

 

 

 

 

 

*

 

 

 

 

 

 

 

*

 

 

 

 

  surface

 

*

*

*

 

*

*

*

*

 

 

*

 

 

*

*

*

 

*

 

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