ЛАБОРАТОРИЯ ПО

ИЗЧИСЛИТЕЛНА ХИМИЯ И ФОТОХИМИЯ

 

Състав:

Проф. дхн Васил Делчев - ръководител

Доц. д-р Иван Щерев (външен сътрудник от УХТ)

 

 

                Лабораторията провежда изследвания в областта на изчислителната химия и теоретичната и експериментална фотохимия. Изследванията целят да обяснят механизмите на реакции в основно и възбудено електронно състояние, т.е. на термични и фотохимични реакции.

ТЕРМИЧНИ РЕАКЦИИ

Включват изследвания на водородни връзки в биологично важни молекули с помощтта на ab initio квантовохимични методи като HF, МР2, СС2, DFT, CASSCF и др. Досега са изследвани голям брой органични съединения - малонов алдехид, малонилмонохалогениди, малонилцистеамин, ацетилацетон, барбитурова киселина, гуанин, урацил и др. Теоретичните изследвания продължават с моделиране на реакции на водороден пренос в барбитурати, тимин, цитозин и др. както в газова фаза така и в разтворители.

ФОТОХИМИЧНИ РЕКАЦИИ

Обект на изследване са азотните бази на нуклеиновите   киселини. Изучават се процесите на вътрешна конверсия на възбудените състояния (най-вече пи-пи* състоянията) до основно състояние през конични сечения So/S1. Интерес представялват реакциите на циклодимеризация на пиримидиновите бази до цис-син циклодимери, които се получават при УВ облъчване на съединенията. В това направление работим съвместно с ТУ Мюнхен, гупата по Теоретична химия с ръководител проф. В. Домке и ТУ Виена - сътрудник: старши изследовател д-р Ернст Хоркел.

Фотостабилността на различните съединения се изследва експериментално във фотореактор.

           

Проект КП-06-Н59/7: Фотохимия на (изо)гуанин-(изо)цитозин базовите двойки

 

********************************************************* ПРИЛОЖЕНИЯ **************************************************************

 

ПРОГРАМЕН ПАКЕТ TURBOMOLE (лицензиран за ПУ)

 

ПРОГРАМЕН ПАКЕТ GAUSSIAN 16 (лицензиран за ПУ) - ВХОДНИ ФАЙЛОВЕ

The input file has 3 job steps:

1) HF/STO-3G energy job saving NBOs, so it is easier to find the sigma and sigma* orbitals that one is interested in,

2) CAS(4,4)/STO-3G energy job reading the NBOs from the previous checkpoint file and using Guess=Alter to move the desired orbitals to the active space,

3) CAS(4,4)/3-21G* geometry optimization freezing the C6-N13 bond distance. Geometry optimizations with CASSCF need the "Opt=NoLinear" option to turn off MO guess interpolation by the geometry optimization linear step (if a geometry optimization step happens to take you in a direction that goes up in energy).

SPHEREONH=9 Това се пише за атома, който излиза извън сферата на разтворителя (в случая атом 9)

Ядрото, което трябва да се изключи (съз заряд нула) се задава с командата

12 Nuc 0.0 Занулява ядрото на атом 12

 

 

ПРОГРАМЕН ПАКЕТ GAМЕSS - ВХОДНИ ФАЙЛОВЕ

Блокът с коефициентите на SCF орбиталите се записва в dat файла от скрач директорията на програмата. Копират се от него и се поставят във входния файл за втората стъпка.

NORB=140 Задава броя на орбиталите от първата стъпка. Броя SCF орбитали.

NMCC=29 заети с електрони МО извън активното пространство (closed) - в случая 29

NDCO=6 МО от активното пространство, заети с два електрона - в случая 6

NVAL=4 МО от активното пространство незаети - свободни - в случая 4

Блокът с коефициентите на MCSCF орбиталите се записва в dat файла от скрач директорията на програмата. Копират се от него и се поставят във входния файл за третата стъпка.

Във файла има опция за ротация на орбиталите в активното пространство.

С ротация на орбиталите в активното пространство.

С опция за включмане на модел на разтворител (в случая вода)

За изчисления с разтворител, който не е дефиниран в стандартната листа разтворители на GAMESS. Задължително се записва ICAV=0
EPSINF=square of the refractive index of the solvent

 

ПРОГРАМЕН ПАКЕТ MOLPRO 2025.1- ВХОДНИ ФАЙЛОВЕ